華為云聯(lián)合上海營(yíng)養(yǎng)與健康研究所、上海巴斯德所，推出新冠病毒基因自動(dòng)化鑒定云平臺(tái)

　　2月10日，由中國(guó)科學(xué)院上海營(yíng)養(yǎng)與健康研究所、中國(guó)科學(xué)院上海巴斯德研究所共同開發(fā)，由華為云提供技術(shù)支撐的新冠病毒基因組自動(dòng)化鑒定平臺(tái)(Virus Identification Cloud, VIC)正式上線，將推動(dòng)疫情的診治與防控，大幅提高診斷效率。

　　如何精準(zhǔn)高效地診斷病人是否感染新型冠狀病毒，是當(dāng)前防控工作的關(guān)鍵問題。國(guó)家衛(wèi)健委發(fā)布的《新型冠狀病毒感染的肺炎診療方案(試行第五版)》，對(duì)鑒別診斷要求，“單從臨床表現(xiàn)、胸部影像學(xué)難以鑒別，需依靠病原學(xué)檢測(cè)來區(qū)分。”

　　基因組測(cè)序是新型冠狀病毒疑似病例確診的病原學(xué)證據(jù)之一，是病毒朔源、變異進(jìn)化、致病機(jī)理等研究的基礎(chǔ)性工作，在疫情防控、疾病診治、藥物篩選、疫苗設(shè)計(jì)等工作中也發(fā)揮著不可替代的基礎(chǔ)性的作用，與國(guó)家衛(wèi)健委要求高度契合。

　　圖：病毒采樣與分析流程

　　VIC平臺(tái)直接對(duì)接二代基因測(cè)序原始數(shù)據(jù)，具有對(duì)數(shù)據(jù)全自動(dòng)質(zhì)量控制、拼接和病毒組成分析等功能，實(shí)現(xiàn)了快速檢測(cè)樣本中可能存在的包括新型冠狀病毒在內(nèi)的各種病毒，并在線分析其相對(duì)載量，基于分析結(jié)果，精準(zhǔn)識(shí)別病毒基因特性，監(jiān)測(cè)病毒變異趨勢(shì)，為后續(xù)的疫苗與藥物研發(fā)提供數(shù)據(jù)支撐。

　　VIC平臺(tái)實(shí)現(xiàn)了從病毒組基因組測(cè)序到基因組拼接與鑒定的“一鍵式”自動(dòng)化服務(wù)，極大簡(jiǎn)化了操作流程。各醫(yī)院只需上傳病例原始數(shù)據(jù)至云端，即可觸發(fā)自動(dòng)化的病毒基因分析流程，并獲得該病例的全基因組分析結(jié)果。

　　華為云容器為VIC平臺(tái)提供了自動(dòng)化測(cè)序分析引擎和強(qiáng)大的算力，支持高通量多樣本云端并行分析。分析結(jié)果不僅能為全面分析研究患者的呼吸道病毒組、研究其致病因子提供支撐，還可以幫助醫(yī)院進(jìn)行臨床診斷，為采用相應(yīng)的治療措施提供參考，同時(shí)還可監(jiān)測(cè)病毒變異趨勢(shì)，便于醫(yī)院各界提前做出應(yīng)對(duì)措施。

　　圖：VIC分析流程

　　目前，上海市公共衛(wèi)生臨床中心，上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬瑞金醫(yī)院、中國(guó)科學(xué)院廣州生物醫(yī)藥與健康研究院作為平臺(tái)的首批用戶，已在VIC上完成了批量新型冠狀病毒肺炎患者樣本的基因組原始測(cè)序數(shù)據(jù)分析。

　　圖：序列物種分布餅圖

　　據(jù)悉，在疫情結(jié)束前，VIC面向科研用戶免費(fèi)開放。

　　使用平臺(tái)服務(wù)，請(qǐng)?jiān)L問：

　　http://www.biosino.org/vic/

　　http://hvic.biosino.org/

　　聯(lián)系方式：ncov@picb.ac.cn